MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 109861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	TA	3	6	33	38	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016627	T	6	6	119	124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016627	ATT	2	6	132	137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016627	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016627	CAA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016627	TTG	2	6	199	204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016627	ATT	2	6	216	221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016627	A	6	6	222	227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016627	TG	3	6	243	248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016627	TAA	3	9	261	269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016627	ACA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016627	TAA	2	6	291	296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016627	TAAT	2	8	304	311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016627	T	8	8	318	325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016627	ATT	3	9	369	377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016627	TAT	2	6	409	414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016627	AT	3	6	422	427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016627	TTAA	2	8	432	439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016627	ATC	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016627	TTAC	2	8	540	547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016627	AT	3	6	548	553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016627	GGA	2	6	556	561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016627	ATA	2	6	682	687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294494
24	NC_016627	TACA	2	8	776	783	50 %	25 %	0 %	25 %	374294494
25	NC_016627	TGT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294494
26	NC_016627	TGG	2	6	1004	1009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294494
27	NC_016627	ATGC	2	8	1035	1042	25 %	25 %	25 %	25 %	374294494
28	NC_016627	TGC	2	6	1057	1062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294494
29	NC_016627	TCA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294494
30	NC_016627	TCT	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294494
31	NC_016627	TTA	2	6	1120	1125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294494
32	NC_016627	GAA	2	6	1149	1154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
33	NC_016627	GAT	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294494
34	NC_016627	AGAA	2	8	1220	1227	75 %	0 %	25 %	0 %	374294494
35	NC_016627	GAA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
36	NC_016627	TTC	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294494
37	NC_016627	CAAA	3	12	1270	1281	75 %	0 %	0 %	25 %	374294494
38	NC_016627	GAA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
39	NC_016627	A	7	7	1412	1418	100 %	0 %	0 %	0 %	374294494
40	NC_016627	ATT	2	6	1452	1457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294494
41	NC_016627	CAA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294494
42	NC_016627	AGA	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
43	NC_016627	A	7	7	1683	1689	100 %	0 %	0 %	0 %	374294494
44	NC_016627	TAC	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294494
45	NC_016627	A	6	6	1819	1824	100 %	0 %	0 %	0 %	374294494
46	NC_016627	GAA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
47	NC_016627	A	6	6	1877	1882	100 %	0 %	0 %	0 %	374294494
48	NC_016627	TA	4	8	1910	1917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016627	AT	3	6	1959	1964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016627	CAA	3	9	1965	1973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016627	AT	3	6	1990	1995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016627	CAA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016627	T	7	7	2039	2045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016627	T	6	6	2047	2052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016627	ATT	2	6	2148	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016627	TAA	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016627	TTA	2	6	2240	2245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016627	TAT	2	6	2247	2252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016627	A	6	6	2257	2262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016627	AT	3	6	2269	2274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016627	AAGA	2	8	2297	2304	75 %	0 %	25 %	0 %	374294495
62	NC_016627	TAC	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
63	NC_016627	ATGTT	2	10	2462	2471	20 %	60 %	20 %	0 %	374294495
64	NC_016627	AAG	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
65	NC_016627	TTC	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294495
66	NC_016627	CTTC	2	8	2652	2659	0 %	50 %	0 %	50 %	374294495
67	NC_016627	A	6	6	2663	2668	100 %	0 %	0 %	0 %	374294495
68	NC_016627	A	6	6	2692	2697	100 %	0 %	0 %	0 %	374294495
69	NC_016627	GAAAAT	2	12	2850	2861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294495
70	NC_016627	GTA	2	6	2874	2879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294495
71	NC_016627	TAC	2	6	2914	2919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
72	NC_016627	GAA	2	6	2928	2933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
73	NC_016627	AAATC	2	10	2957	2966	60 %	20 %	0 %	20 %	374294495
74	NC_016627	ATT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294495
75	NC_016627	AT	3	6	3082	3087	50 %	50 %	0 %	0 %	374294495
76	NC_016627	GAA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
77	NC_016627	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	374294495
78	NC_016627	ATT	2	6	3171	3176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294495
79	NC_016627	GGA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294495
80	NC_016627	TAC	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
81	NC_016627	GAT	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294495
82	NC_016627	GAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
83	NC_016627	AT	4	8	3307	3314	50 %	50 %	0 %	0 %	374294495
84	NC_016627	AAC	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294495
85	NC_016627	A	6	6	3395	3400	100 %	0 %	0 %	0 %	374294495
86	NC_016627	AT	3	6	3456	3461	50 %	50 %	0 %	0 %	374294496
87	NC_016627	TAA	2	6	3524	3529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294496
88	NC_016627	GAAA	2	8	3575	3582	75 %	0 %	25 %	0 %	374294496
89	NC_016627	ACA	2	6	3614	3619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294496
90	NC_016627	A	6	6	3719	3724	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
91	NC_016627	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
92	NC_016627	T	7	7	3781	3787	0 %	100 %	0 %	0 %	374294497
93	NC_016627	CAGG	2	8	3796	3803	25 %	0 %	50 %	25 %	374294497
94	NC_016627	AAC	2	6	3849	3854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294497
95	NC_016627	TA	3	6	3858	3863	50 %	50 %	0 %	0 %	374294497
96	NC_016627	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
97	NC_016627	AAT	2	6	3905	3910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
98	NC_016627	AAAT	2	8	3940	3947	75 %	25 %	0 %	0 %	374294497
99	NC_016627	A	9	9	3958	3966	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
100	NC_016627	AGA	3	9	4047	4055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
101	NC_016627	GCA	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294497
102	NC_016627	CT	4	8	4139	4146	0 %	50 %	0 %	50 %	374294497
103	NC_016627	A	7	7	4164	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
104	NC_016627	AT	3	6	4189	4194	50 %	50 %	0 %	0 %	374294497
105	NC_016627	ATA	2	6	4227	4232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
106	NC_016627	TA	3	6	4279	4284	50 %	50 %	0 %	0 %	374294497
107	NC_016627	TAA	2	6	4301	4306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
108	NC_016627	ATT	2	6	4324	4329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
109	NC_016627	A	6	6	4366	4371	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
110	NC_016627	AGA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
111	NC_016627	AAT	2	6	4418	4423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
112	NC_016627	AT	4	8	4467	4474	50 %	50 %	0 %	0 %	374294497
113	NC_016627	ATA	2	6	4557	4562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
114	NC_016627	AGA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
115	NC_016627	TGA	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294497
116	NC_016627	AAT	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
117	NC_016627	TTA	2	6	4672	4677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
118	NC_016627	T	6	6	4696	4701	0 %	100 %	0 %	0 %	374294497
119	NC_016627	T	7	7	4726	4732	0 %	100 %	0 %	0 %	374294497
120	NC_016627	A	6	6	4739	4744	100 %	0 %	0 %	0 %	374294497
121	NC_016627	TAT	2	6	4824	4829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016627	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016627	TA	3	6	4899	4904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016627	AAATAA	2	12	4917	4928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016627	AGG	2	6	4993	4998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016627	TGG	2	6	5018	5023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294498
127	NC_016627	TGT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294498
128	NC_016627	CTA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294498
129	NC_016627	GAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294498
130	NC_016627	TAT	2	6	5168	5173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294498
131	NC_016627	AT	3	6	5199	5204	50 %	50 %	0 %	0 %	374294498
132	NC_016627	TAAA	2	8	5270	5277	75 %	25 %	0 %	0 %	374294498
133	NC_016627	TA	3	6	5284	5289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016627	TAAA	2	8	5305	5312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016627	TAA	2	6	5316	5321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016627	TTA	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016627	A	8	8	5373	5380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016627	ATTT	2	8	5404	5411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016627	AGG	2	6	5422	5427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016627	ATG	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294499
141	NC_016627	TCA	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294499
142	NC_016627	AAT	2	6	5573	5578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294499
143	NC_016627	GAAATA	2	12	5619	5630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374294499
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279	NC_016627	TCA	2	6	10495	10500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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